Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Il6stQ00560 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Il6stQ00560 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms