Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GabpaQ00422 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms