Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx2Q00262 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms