Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms