Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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