Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AlkP97793 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AlkP97793 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AlkP97793 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AlkP97793 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AlkP97793 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
AlkP97793 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
AlkP97793 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AlkP97793 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AlkP97793 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AlkP97793 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AlkP97793 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlkP97793 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlkP97793 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AlkP97793 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AlkP97793 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms