Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cmklr1P97468 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Cmklr1P97468 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cmklr1P97468 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cmklr1P97468 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cmklr1P97468 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cmklr1P97468 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cmklr1P97468 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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