Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms