Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms