Protein–RNA interactions for Protein: P81270

Erg, Transcriptional regulator ERG, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErgP81270 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErgP81270 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErgP81270 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErgP81270 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ErgP81270 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ErgP81270 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ErgP81270 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ErgP81270 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ErgP81270 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ErgP81270 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ErgP81270 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms