Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms