Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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