Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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