Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tp53bp1P70399 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms