Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smad1P70340 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms