Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad54lP70270 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms