Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig1P70193 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrig1P70193 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrig1P70193 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrig1P70193 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms