Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms