Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d2P62838 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms