Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms