Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps18P62270 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps18P62270 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms