Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms