Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch1P62046 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms