Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufm1P61961 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufm1P61961 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms