Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnnP61807 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnnP61807 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnnP61807 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnnP61807 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnnP61807 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnnP61807 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnnP61807 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnnP61807 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnnP61807 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnnP61807 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnnP61807 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnnP61807 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnnP61807 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnnP61807 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnnP61807 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnnP61807 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SnnP61807 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnnP61807 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms