Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga11P61622 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms