Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd6P61407 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd6P61407 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd6P61407 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd6P61407 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd6P61407 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd6P61407 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd6P61407 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd6P61407 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms