Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr3bP59470 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms