Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hps5P59438 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hps5P59438 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms