Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Paxbp1P58501 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms