Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms