Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms