Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp1P52624 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp1P52624 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms