Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClgnP52194 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms