Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MipP51180 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MipP51180 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MipP51180 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MipP51180 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MipP51180 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MipP51180 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MipP51180 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MipP51180 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms