Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TubP50586 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TubP50586 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TubP50586 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TubP50586 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TubP50586 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TubP50586 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TubP50586 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TubP50586 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TubP50586 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms