Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbrP50284 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LtbrP50284 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms