Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms