Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms