Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms