Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms