Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms