Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic1P46684 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic1P46684 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic1P46684 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic1P46684 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zic1P46684 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic1P46684 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zic1P46684 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic1P46684 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic1P46684 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zic1P46684 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic1P46684 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms