Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms