Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmx2P43687 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms