Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms