Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PtgfrP43117 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PtgfrP43117 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtgfrP43117 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtgfrP43117 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtgfrP43117 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtgfrP43117 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtgfrP43117 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtgfrP43117 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtgfrP43117 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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