Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tnfsf9P41274 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfsf9P41274 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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