Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd9P40240 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms