Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf1P39428 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms